La microbiologie est la science qui sert à étudier  les micro-organismes  (du grec, mikros :petit et bios : vie) qui sont représentés par un ensemble hétérogène d’organismes vivants microscopiques, invisibles à l’oeil nu ,  il s’agisse de :  protistes  (bactéries, protozoaires, Mycètes), d’ algues microscopique et de  virus (microorganismes non vivants, acellulaires dépendent entièrement des cellules hôtes infectées). Ces microorganismes  diffèrent et varient par leur morphologie, physiologie, mode de reproduction,  écologie , effets  bénéfiques et pouvoir pathogène. Une connaissance approfondie de leur caractéristiques facilite notre compréhension du monde vivant au niveau microscopique et même nous permettre  d’étudier et de comprendre des phénomènes physiologiques similaires rencontrés chez des êtres plus complexes comme l’être humain. La grande majorité des microorganismes sont bénéfiques et utilisés dans de nombreuses industries : alimentaire, pharmaceutique , médicales et thérapeutique.  La microbiologie est donc une science pluridisciplinaire regroupant la bactériologie, la protozoologie, la mycologie, l’algologie et la virologie. C’est la base de génie génétique, de protéomique, de génomique et de séquençage des génomes microbiens  qui ont permis des avancées majeures dans la domestication et l’utilisation des microorganismes